GO term | Total | Higher in Col-0 | Higher in pad4–1 sid2–1 | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
T0 | T1 | T3 | T6 | T8 | T10 | T12 | T0 | T1 | T3 | T6 | T8 | T10 | T12 | ||
PTI | |||||||||||||||
 Receptor protein kinase signaling pathway | 522 |  |  | 15 | 9 | 10 | 20 | 33 |  |  |  |  |  |  |  |
 MAPK cascade | 86 | 8 | 10 | 13 | 10 | 10 | 14 | 20 |  |  |  |  |  |  |  |
 Protein kinase activity | 1110 | 17 |  | 31 | 19 | 22 | 34 | 56 |  |  |  |  |  |  |  |
SA-associated | |||||||||||||||
 SA-mediated signaling pathway | 62 |  |  | 7 | 4 | 4 | 7 | 12 |  |  |  |  |  |  |  |
 SA biosynthetic process | 79 | 13 | 8 | 18 | 11 | 13 | 16 | 26 |  |  |  |  |  |  |  |
 Systemic acquired resistance | 125 | 12 | 9 | 27 | 18 | 23 | 26 | 34 |  |  |  |  |  |  |  |
 Response to SA | 152 | 5 | 6 | 9 | 7 | 9 | 15 | 18 |  |  |  |  |  |  |  |
 JA-mediated signaling pathway | 99 | 5 | 5 | 9 | 8 | 9 | 13 | 18 |  |  |  |  |  |  |  |
 Defense response | 464 | 7 |  | 10 |  |  |  | 19 |  |  |  |  |  |  |  |
 Defense response to fungus | 488 | 11 | 13 | 24 | 16 | 17 | 26 | 34 |  |  |  |  | 8 |  |  |
 Defense response, incompatible interaction | 41 |  | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 8 |  |  |  |  |  |  |  |
 Regulation of defense response | 66 |  | 4 | 8 | 5 | 6 | 7 | 8 |  |  |  |  |  |  |  |
 Regulation of plant-type HR | 121 | 5 | 5 | 12 | 7 | 7 | 11 | 17 |  |  |  |  |  |  |  |
 Senescence | 64 |  | 2 |  | 2 | 2 |  | 6 |  |  |  |  |  |  |  |
Others | |||||||||||||||
 Response to chitin | 234 | 6 | 5 | 11 | 6 |  | 14 | 27 | 5 |  |  | 7 | 8 | 5 | 3 |
 Protein targeting to membrane | 124 | 5 | 5 | 12 | 7 | 7 | 11 | 17 |  |  |  |  |  |  |  |
 Response to ER stress | 82 |  | 4 | 7 | 6 | 6 | 7 | 9 |  |  |  |  |  |  |  |
 Response to oxidative stress | 260 |  |  |  |  |  | 12 | 14 |  |  |  |  |  |  |  |
 Calcium ion binding | 282 |  |  | 8 |  | 7 | 10 | 14 |  |  |  |  |  |  |  |
 ATP binding | 2406 |  |  | 28 |  |  |  | 56 |  |  |  |  |  |  |  |
 Abscisic acid-activated signaling pathway | 215 |  |  |  |  |  |  | 11 |  |  |  |  |  |  |  |
 Plasmodesma | 1369 |  |  | 29 | 16 | 17 | 29 | 50 |  |  |  |  |  |  |  |
 Apoplast | 449 |  |  | 10 | 8 | 10 | 12 |  |  |  |  |  | 8 |  |  |
 Detection of biotic stimulus | 25 | 7 | 4 | 9 | 6 | 7 | 9 | 13 |  |  |  |  |  |  |  |
 Vacuole | 572 |  |  | 12 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |
Detoxification | |||||||||||||||
 Toxin catabolic process | 89 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 8 | 6 | 4 | 4 |
 Response to toxic substance | 67 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 8 | 3 | 4 | 5 |
 Proline transport | 38 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 6 | 4 | 5 | 4 |
 Amino acid transport | 53 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 4 | 3 | 4 | 2 |
 Glutathione transferase activity | 53 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 5 | 2 | 3 | 3 |
 Flavonoid biosynthetic process | 144 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 6 | 4 | 6 | 7 |
 Flavonoid glucuronidation | 114 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 6 | 3 | 4 | 4 |
 Flavonol biosynthetic process | 12 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 2 | 2 | 3 |
 UDP-glucosyltransferase activity | 24 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 5 | 3 | 2 |  |
 Intracellular membrane-bounded organelle | 157 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 7 | 3 | 4 | 5 |
 Quercetin 3-O-glucosyltransferase activity | 112 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 6 | 3 | 4 | 4 |
Secondary metabolism | |||||||||||||||
 Apoplast | 449 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 8 | 8 | 6 | 6 |
 Chitin binding | 25 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 3 | 3 | 2 | 3 |
 Chitin catabolic process | 26 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 3 | 4 | 2 | 3 |
 Chitinase activity | 25 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 3 | 3 | 2 | 3 |
 Indole glucosinolate metabolic process | 25 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 4 | 1 | 2 |
 Response to nitrate | 81 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 2 | 5 | 3 | 3 |
 Response to other organism | 27 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 3 | 3 | 6 | 7 |
 Cellular response to hydrogen peroxide | 4 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 2 | 2 | 1 |  |
 Intracellular membrane-bounded organelle | 157 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 7 | 3 | 4 | 5 |